Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4DQ86TL0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms