Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TRAPPC6BQ86SZ2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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