Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG4Q86SJ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG4Q86SJ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG4Q86SJ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms