Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAPQ7Z569 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRAPQ7Z569 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms