Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG9AQ7Z3C6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG9AQ7Z3C6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms