Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEGR1Q7Z3B1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEGR1Q7Z3B1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms