Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCF23Q7RTU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCF23Q7RTU1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms