Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC29A4Q7RTT9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC29A4Q7RTT9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms