Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPUQ71F23 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPUQ71F23 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms