Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms