Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00114Q6XXX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00114Q6XXX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00114Q6XXX2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms