Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSMFQ6X4W1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMFQ6X4W1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMFQ6X4W1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms