Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO4Q6UY18 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO4Q6UY18 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms