Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBR1LQ6UX01 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms