Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCLAT1Q6UWP7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCLAT1Q6UWP7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms