Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATRAIDQ6UW56 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms