Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP20A1Q6UW02 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYP20A1Q6UW02 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms