Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDF2Q6PJF5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF2Q6PJF5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms