Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM88Q6PEY1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms