Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms