Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK5Q6P3R8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms