Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED27Q6P2C8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms