Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC42EP5Q6NZY7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms