Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD54Q6NXT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54Q6NXT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54Q6NXT1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms