Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHEQ5VZ18 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms