Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CHIC1Q5VXU3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CHIC1Q5VXU3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CHIC1Q5VXU3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms