Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHAF4Q5VUM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms