Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPANXN1Q5VSR9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPANXN1Q5VSR9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms