Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SOGA3Q5TF21 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms