Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYCQ5MJ68 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYCQ5MJ68 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms