Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A3Q5K4L6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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