Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB41Q5JT25 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB41Q5JT25 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms