Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHSL2Q5HYW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms