Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGO2Q562F6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms