Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALFQ53S48 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALFQ53S48 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms