Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6CQ53S08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB6CQ53S08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6CQ53S08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms