Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms