Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP221Q4G0U5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms