Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC25A52Q3SY17 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms