Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL9Q3SXZ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms