Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TWISTNBQ3B726 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TWISTNBQ3B726 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TWISTNBQ3B726 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms