Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL40Q2TBA0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms