Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC6LQ2NKX8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms