Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GEN1Q17RS7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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