Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B3Q16720 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B3Q16720 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B3Q16720 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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