Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MRPL23Q16540 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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