Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNB3Q15768 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNB3Q15768 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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