Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HMGN3Q15651 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGN3Q15651 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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