Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SF1Q15637 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF1Q15637 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF1Q15637 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF1Q15637 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF1Q15637 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF1Q15637 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF1Q15637 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF1Q15637 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF1Q15637 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF1Q15637 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SF1Q15637 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF1Q15637 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF1Q15637 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF1Q15637 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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