Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAF11Q15544 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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